南京师范大学医院为一级乙等医院。主要职能是为全校师生提供医疗、预防、保健、健康教育等工作等服务。 校医院位于随园、紫金、仙林三个校区内。医院建筑面积约2555平方米。设置病床24张。

　　    校医院设有内科、外科、预防保健科、眼科、耳鼻咽喉科、口腔科、药房、化验室、放射室、心电图室等科室。现有医技人员62人。医院配置有B超诊断仪、全自动生化分析仪、医用诊断X光诊断机、ABX血液分析仪、牙科综合治疗机、普利生血流变仪、尿液分析仪、血红蛋白仪、快速血糖仪、全自动分析心电图机、裂隙灯、低频电子脉冲治疗仪、高级电脑中频治疗仪、周林频谱仪、超短波电疗机、脉冲针灸治疗仪、立式单头神灯、低温治疗仪。

　　    校医院主要承担师生员工（含外籍教师、留学生）、教职工子女的基本医疗服务，诊断处理常见病、多发病和部分疑难危重症；承担学校传染病预防和管理、公共卫生突发事件的应急处理、公共场所的卫生监督、各类人员的健康体检、慢性非传染性疾病的预防干预等工作；定期对各类人群进行健康体检和妇女病普查；对计划生育进行技术指导；承担大学生健康教育公共选修课的教学任务，积极开展形式多样的疾病预防、健康教育、保健康复等活动。