保健院分设临床部和保健部，临床部有围产科(普通产科、母体医学部、胎儿医学部、内科、新生儿科)，妇科(普通妇科、妇科肿瘤、妇科内分泌、宫颈与宫腔疾病、乳腺科)，计划生育科、辅助生殖医学科、中医妇科、麻醉科、重症医学科等；保健部有预防保健科、健康教育科、儿童保健门诊等。门诊设有普通门诊、专科专病门诊、专家门诊、特需门诊等。保健院“不孕症会诊中心”，整合了妇科、男性科、内分泌科、超声影像、放射科介入技术及辅助生育技术等技术优势，提高了不孕症治疗的成功率，也推动了妇科各亚学科的发展。