东莞市妇幼保健院生殖医学中心是东莞妇幼保健院重点发展的一门特色学科，医院各级领导高度重视，本着高质量高标准的理念，已建成了珠三角一流的生殖医学中心。中心占地面积达2000余平方米，设立了女科门诊、男科门诊、实验室（包括男科实验室、体外受精实验室和遗传实验室等）。配备了一流的医疗设备，包括ASTEC工作站、显微操纵系统、Labotect二氧化碳培养箱以及美国Hamilton激光破膜系统、西班牙SCA精液分析系统和ABI基因测序仪等，还配置了实验室报警和指纹识别系统以实时进行监控，杜绝错误发生。