张家港市疾病预防控制中心于2002年1月8日成立，另对外挂牌张家港市卫生检测中心。是集突发公共卫生事件应急处置、疾病预防与控制、健康危害因素监测控制等职能为一体的综合性疾病预防控制机构。中心现有正式职工101名，其中卫技人员81名，占职工总数的80％，高级卫技人员11名，中级28名，占卫技人员总数的48%，形成了较为合理的专业技术人员队伍结构。2003年新建疾控卫生检测大楼，建筑面积达7500平方米。实验室建有整体万级的净化实验室和艾滋病初筛实验室等，配置了全自动生化分析仪、高效液相色谱仪、气相色谱仪、离子色谱仪等一批精密仪器设备。2004－2005年先后引进了卫生检测、从业人员体检、职业健康监护、收费、办公自动化等应用软件操作系统，实施计算机信息化管理。按照GB/T15481－2000，CNAL/AC05，CNAL/AC06的要求，建立了新型质量体系，2004年9月取得了中国实验室国家认可（CNAL）证书（NO.L1654），认可项目有食品及食品包装材料、水质、公共场所、职业卫生、化妆品、消毒杀虫等7大类149项。