非淋菌性尿道炎是一种除淋球菌以外的病原体感染的尿道炎，能诱发非淋的病因多种多样，正常人的尿液中就普遍含有这些细菌。有人做过这样的研究，对131例正常人进行清洁中段尿的培养，80例有细菌生长，占61.1% 。即使以导尿标本作细菌培养，也有细菌生长，而且细菌可以侵入膀胱，但并不都能引起非淋。

这是因为人体有一定的防御能力。膀胱粘膜有灭菌能力，通过粘膜分泌的IgA、有机酸和人体的吞噬细胞共同作用，可消灭细菌;

由输尿管来的尿液不断流入膀胱，将有细菌的尿液稀释，并于排尿时带走细菌，当尿流通畅，膀胱能完全排空的情况下，细菌不易在尿路滞留;

大多数人的尿呈酸性，尿素浓度高，有机酸浓度高，加上低张或高张尿，均不利于细菌生长;

以上防御机能如果仍不能清除细菌，则膀胱粘膜可分泌抗体，以对抗细菌入侵。

但是，当存在某些不利因素时，人体失去上述自卫功能，例如：过度疲劳、感冒、个人卫生不注意等，细菌乘虚而入，就会发生非淋菌性尿道炎。